Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm5Q9D806 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm5Q9D806 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms