Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rep15Q9D7T1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rep15Q9D7T1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rep15Q9D7T1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rep15Q9D7T1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rep15Q9D7T1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rep15Q9D7T1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rep15Q9D7T1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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