Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capns2Q9D7J7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms