Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp4cQ9D7F7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4cQ9D7F7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp4cQ9D7F7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms