Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MsraQ9D6Y7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MsraQ9D6Y7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms