Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tube1Q9D6T1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tube1Q9D6T1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tube1Q9D6T1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms