Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PudpQ9D5U5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms