Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lpcat2bQ9D5U0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpcat2bQ9D5U0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms