Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D4W2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D4W2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms