Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ribc2Q9D4Q1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ribc2Q9D4Q1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms