Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc6Q9D4E6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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