Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce1Q9D495 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syce1Q9D495 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms