Protein–RNA interactions for Protein: Q9D476

4933407L21Rik, RIKEN cDNA 4933407L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933407L21RikQ9D476 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933407L21RikQ9D476 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933407L21RikQ9D476 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms