Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap53Q9D439 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cfap53Q9D439 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms