Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pus10Q9D3U0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms