Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed11Q9D2R4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed11Q9D2R4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms