Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Necap2Q9D1J1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms