Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Susd3Q9D176 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd3Q9D176 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd3Q9D176 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd3Q9D176 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd3Q9D176 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd3Q9D176 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd3Q9D176 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Susd3Q9D176 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Susd3Q9D176 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Susd3Q9D176 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Susd3Q9D176 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Susd3Q9D176 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms