Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm12Q9D0R8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm12Q9D0R8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms