Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NkapQ9D0F4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NkapQ9D0F4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NkapQ9D0F4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms