Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2e1Q9D0D5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms