Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp3Q9CZX0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms