Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shmt2Q9CZN7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms