Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem39aQ9CYC3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39aQ9CYC3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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