Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChtopQ9CY57 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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