Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nip7Q9CXK8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nip7Q9CXK8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms