Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms