Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pin4Q9CWW6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pin4Q9CWW6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms