Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd12Q9CWU0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd12Q9CWU0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.2 ms