Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psma8Q9CWH6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Psma8Q9CWH6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Psma8Q9CWH6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Psma8Q9CWH6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Psma8Q9CWH6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Psma8Q9CWH6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Psma8Q9CWH6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms