Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Sycp2Q9CUU3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Sycp2Q9CUU3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.42
Sycp2Q9CUU3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Sycp2Q9CUU3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms