Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd1Q9CR42 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd1Q9CR42 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms