Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4931417E11RikQ9CR05 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms