Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr3kQ9CQZ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms