Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg12Q9CQY1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms