Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ykt6Q9CQW1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ykt6Q9CQW1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms