Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Nicn1Q9CQM0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Nicn1Q9CQM0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nicn1Q9CQM0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nicn1Q9CQM0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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