Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CQF4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQF4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms