Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl11Q9CQF0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl11Q9CQF0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms