Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nipsnap3bQ9CQE1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms