Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQC3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9CQC3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQC3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9CQC3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms