Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3bpQ9CQ82 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms