Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpa3Q9CQ71 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpa3Q9CQ71 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpa3Q9CQ71 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpa3Q9CQ71 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpa3Q9CQ71 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rpa3Q9CQ71 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rpa3Q9CQ71 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rpa3Q9CQ71 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms