Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrc18Q9CQ07 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms