Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Commd4Q9CQ02 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Commd4Q9CQ02 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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