Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bhlhe41Q99PV5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bhlhe41Q99PV5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms