Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scd3Q99PL7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scd3Q99PL7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scd3Q99PL7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scd3Q99PL7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scd3Q99PL7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scd3Q99PL7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scd3Q99PL7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Scd3Q99PL7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms