Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rrbp1Q99PL5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rrbp1Q99PL5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms