Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rad54l2Q99NG0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rad54l2Q99NG0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rad54l2Q99NG0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rad54l2Q99NG0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rad54l2Q99NG0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rad54l2Q99NG0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rad54l2Q99NG0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rad54l2Q99NG0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rad54l2Q99NG0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Rad54l2Q99NG0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Rad54l2Q99NG0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Rad54l2Q99NG0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms