Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vgll1Q99NC0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll1Q99NC0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms